南宋年间，通古县前任县令为了一己私利，运用“河神”为幌子暗中掳掠儿童，百姓惶惶不安，在其迷惑下纷繁置信誉孩童祭奠“河神”可以停息灾祸。宋慈授命离守旧古，向百姓一再声明祭奠河神纯属无稽之谈，并保证一定会查出事情真相，他的到来使得老县令觉失掉了要挟。在老县令的授意下，其党羽对宋慈阳奉阴违，并暗中施以压榨，希图神不知鬼不觉的将宋慈了却。在一波接一波的风险来临在宋慈身上时，孩童还在不时失踪，这使得老百姓对宋慈失掉了信任，逼宋慈赶忙祭河神。宋慈顶着多方的压力，抽丝剥茧地调查，运用自己拙劣的法医学手腕让尸体“启齿说话”，逐渐锁定了真凶，并发现了面前的庞大阴谋。最终，宋慈不惜以性命相搏将真凶逍遥法外。