第二次世界大战前夕，一名普通的陆军战士（龟梨和也 饰）因协助同伴而殴打长官，随后被军事法庭判处死刑。关键时辰，名叫结城（伊势谷友介 饰）的巧妙女子突然出现，并将之吸纳进专门培育特务的秘密部门——D机关。历经层层考验，青年终于失掉第一项义务。不久前某犹太迷信家遭到暗杀，而他记载着最新式武器设计图的黑色笔记听说落入美国大使埃内斯特·格雷厄姆（Richard Moss 饰）手中。青年化名嘉藤次郎分开了被称为魔都的城市，乘机盗出笔记。与此同时，英、苏、德等国的特工也闻风而动，高峰的特务大战行将展开…… 　　本片依据柳广司的同名系列小说改编。